Kaynak kod kullanılarak R kurulumu

Kaynak kod kullanılarak R kurulumu#

Sistemimizde var olan R’ın farklı versiyonları kurmak için temelde şu adımlar izlenebilir.

  • R kaynak kodu indir

  • Dosyayı aç

  • Klasör içine gir

  • ./configure

  • make

  • make install

Detaylı kurulum aşamaları ve yardım için şu sayfalar ziyaret edilebilir:

Kurulum için yönergeler (Tıklayınız)
# İşlemleri hızlı yapabilmek için sunucu içinde klasöre geçiyoruz.
cd /tmp/
# Yüklü modülleri kaldırıp derleyicimizi yüklüyoruz.
module purge
module load centos7.9/comp/gcc/7

# R kaynak kodu indiriyoruz.
wget https://cran.rstudio.com/src/base/R-4/R-4.2.2.tar.gz
# Sıkıştırılmış dosyayı açıyoruz.
tar -xzvf R-4.2.2.tar.gz
# Kodumuzun bulunduğu dizine geçiş yapıyoruz.
cd R-4.2.2

# Programın kurulacağı dizini belirtiyoruz.
install_dir_gcc=/arf/home/kullanici_adiniz/R/R-4.2.2-gcc

# Kurulum öncesi derleyici ile birlikte ayarlıyoruz.
./configure --with-pcre1=yes --prefix=$install_dir_gcc --enable-memory-profiling --enable-R-shlib

# Derleme işlemini 28 core ile yapıyoruz
make -j28
# prefix ile belirtilen dizine kurulum yapıyoruz.
make install

# İşlemleri hızlı yapabilmek için sunucu içinde klasöre geçiyoruz.
cd /tmp/
# Yüklü modülleri kaldırıp derleyicimizi yüklüyoruz.
module purge
source /truba/sw/centos7.9/comp/intel/oneapi-2021.2/setvars.sh intel64

# R kaynak kodu indiriyoruz.
wget https://cran.rstudio.com/src/base/R-4/R-4.2.2.tar.gz
# Sıkıştırılmış dosyayı açıyoruz.
tar -xzvf R-4.2.2.tar.gz
# Kodumuzu bulunduğu dizine geçiş yapıyoruz.
cd R-4.2.2

# Programın kurulacağı dizini belirtiyoruz.
install_dir_intel=/arf/home/kullanici_adiniz/R/R-4.2.2-intel

# Kurulum öncesi derleyici ile birlikte ayarlıyoruz.
export CC="icc"
export CXX="icpc"
export F77="ifort"
export FC="ifort"
MKL=" -L ${MKLROOT}/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -liomp5 -lpthread -lm -ldl "
./configure --with-pcre1=yes --prefix=$install_dir_intel --enable-R-shlib --enable-memory-profiling --with-blas="$MKL" --with-lapack=yes

# Derleme işlemini 28 core ile yapıyoruz
make -j28
# prefix ile belirtilen dizine kurulum yapıyoruz.
make install